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Phylogénétique bayésienne vs maximum de vraisemblance

Phylogénétique bayésienne vs maximum de vraisemblance
  1. Quelle est la différence entre le maximum de vraisemblance et le bayésien?
  2. Qu'est-ce que la phylogénétique bayésienne?
  3. Quelle est la différence entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance?
  4. Quelle est la probabilité maximale de l'arbre phylogénétique?

Quelle est la différence entre le maximum de vraisemblance et le bayésien?

En d'autres termes, dans l'équation ci-dessus, MLE traite le terme p (θ) p (d) comme une constante et ne nous permet pas d'injecter nos croyances antérieures, p (θ), sur les valeurs probables pour θ dans les calculs d'estimation. Estimation bayésienne, en revanche, calcule complètement (ou parfois approximation) la distribution postérieure p (θ | d).

Qu'est-ce que la phylogénétique bayésienne?

L'approche bayésienne de la reconstruction phylogénétique combine la probabilité antérieure d'un arbre P (a) avec la probabilité des données (b) de produire une distribution de probabilité postérieure sur les arbres P (a | b).

Quelle est la différence entre la parcimonie maximale et le maximum de vraisemblance?

La méthode de vraisemblance maximale cherche à trouver la topologie des arbres qui confère la plus grande probabilité des caractéristiques observées des espèces de pointe. La méthode de parcimonie maximale cherche à trouver la topologie des arbres qui nécessite le moins de changements dans les états de caractère pour produire les caractéristiques de ces espèces de pointe.

Quelle est la probabilité maximale de l'arbre phylogénétique?

La probabilité maximale est une méthode pour l'inférence de la phylogénie. Il évalue une hypothèse sur l'histoire évolutive en termes de probabilité que le modèle proposé et l'histoire hypothétique donnent naissance à l'ensemble de données observé.

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